質問は基本的に1スレッドにつき1つの内容でお願いします。
お問い合わせの際は下記の情報を明記をお願いいたします。
▼ソフトウェアに関するご質問の場合
・【問題が発生したソフトウェア名とバージョン】（例：Cubism Editor 3.1.02、Euclid Editor 1.2.0 など）
・【ご利用のPC環境】例：Windows10、macOS HighSierra など
・【グラフィックボード】例：GeForce GTX 950M など
・【メモリ】例：8GB
・【原画（イラスト）を制作したソフトウェア】例：Photoshop , CLIP STUDIO , SAI など
・【問い合わせ内容がわかるスクリーンショットまたは動画】
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▼SDKに関するご質問の場合
・現象の再現を行い検証させていただきますので、再現する最小のプロジェクトのご提供か、再現するまでの手順
・使用したSDKのバージョン
お問い合わせの際は下記の情報を明記をお願いいたします。
▼ソフトウェアに関するご質問の場合
・【問題が発生したソフトウェア名とバージョン】（例：Cubism Editor 3.1.02、Euclid Editor 1.2.0 など）
・【ご利用のPC環境】例：Windows10、macOS HighSierra など
・【グラフィックボード】例：GeForce GTX 950M など
・【メモリ】例：8GB
・【原画（イラスト）を制作したソフトウェア】例：Photoshop , CLIP STUDIO , SAI など
・【問い合わせ内容がわかるスクリーンショットまたは動画】
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▼SDKに関するご質問の場合
・現象の再現を行い検証させていただきますので、再現する最小のプロジェクトのご提供か、再現するまでの手順
・使用したSDKのバージョン
mocファイルの書き出しが出来ない。（テクスチャアトラスに配置されていないアートメッシュが○○個あります。）
mocファイルを書き出そうとした時に、上記の様な表示（テクスチャアトラスに配置されていないアートメッシュが○○個あります。）が出て書き出しを実行できません。（しても無視される。）
もちろんテクスチャアトラスの編集は出来ています。
一番肝心なmocファイル書き出し（2.1用）に関しては選択をしてもしばらく時間がかかった後、エラーも何も言わずに元の画面に戻ってしまいます。何卒解決のほどよろしくお願い致します。
・【問題が発生したソフトウェア名とバージョン】Cubism Editor 3.1.04
・【ご利用のPC環境】Windows10
・【グラフィックボード】GeForce GTX 1060
・【メモリ】16GB
・【原画（イラスト）を制作したソフトウェア】CLIP STUDIO
もちろんテクスチャアトラスの編集は出来ています。
一番肝心なmocファイル書き出し（2.1用）に関しては選択をしてもしばらく時間がかかった後、エラーも何も言わずに元の画面に戻ってしまいます。何卒解決のほどよろしくお願い致します。
・【問題が発生したソフトウェア名とバージョン】Cubism Editor 3.1.04
・【ご利用のPC環境】Windows10
・【グラフィックボード】GeForce GTX 1060
・【メモリ】16GB
・【原画（イラスト）を制作したソフトウェア】CLIP STUDIO
コメント
・【ご利用のPC環境】例：Windows10
・【グラフィックボード】例：GeForce GTX 1060 など
・【メモリ】 16GB
・【原画（イラスト）を制作したソフトウェア】CLIP STUDIO
・【問い合わせ内容がわかるスクリーンショットまたは動画】
PSDで追加して編集できないからかな
こちらがテクスチャアトラスの画像です。フリー版ではなく、トライアル？版です。
申し訳ないのですが、「PSDで追加して編集出来ない」という意味が分かりません。
新たにテクスチャアトラスの編集をしてみた所ログに大量のエラーを吐いていました。
バージョンの古い2.1をインストールしてみたぐらいです。
とりあえずお騒がせしました、コメントを下さった方もありがとうございました！